菌落計數儀可進行樣品的自動接種和自動菌落計數，計數結果更高效、可追溯性強。菌落總數的測定主要是作為判定食品被細菌污染程度的標志，也可以應用這一方法觀察食品中細菌的性質以及細菌在食品中繁殖的動態，以便對被檢樣品進行衛生學評價時提供科學依據。
目前，菌落計數一般采用的是平板菌落計數法，是種統計物品含菌數的有效方法。
菌落計數儀將待測樣品經適當稀釋之后，其中的微生物充分分散成單個細胞，取一定量的稀釋樣液涂布到平板上，經過培養，由每個單細胞生長繁殖而形成肉眼可見的菌落，即一個單菌落應代表原樣品中的一個單細胞；統計菌落數，根據其稀釋倍數和取樣接種量即可換算出樣品中的含菌數。
在常規的微生物學實驗中，不管是食品衛生細菌學檢測，還是藥品微生物限度檢查，還是研究活性物質的抑菌性能實驗，都常常需要對樣品中的微生物進行定量或者濃度計算；眾多微生物定量方法中常用的就是對培養后的皮氏培養皿上所生長菌落進行總數統計的菌落總數統計定量方法。
菌落總數作為微生物檢測中最常見的項目，在檢驗的每一個環節都應該小心謹慎，精準操作，確保檢測結果的準確度。該儀器為微生物實驗室用戶量身定做，可以在短時間內快準穩地完成大量堆疊平板中的菌落總數的檢測，可自動計數樣品中的菌落，解決手動計數存在的錯記漏記、無存檔記錄等問題，減少操作人員的疲勞切實提高工作效率。
